在小说《神雕侠侣》中，《九阳真经》被潇湘子和尹克西从少林寺藏经阁中盗走，藏于苍猿腹中。后在《倚天屠龙记》中为张无忌所得，张无忌在学成后又将经书埋于原处。

《九阳真经》除著书者外，仅少林寺觉远大师以及张无忌练成整套九阳神功。而在觉远大师行将圆寂时曾默念部分经文，郭襄、张君宝（张三丰）、无色禅师各记下部分内容，后形成峨眉九阳功、武当九阳功、少林九阳功三门上乘内功，郭襄与张君宝也因此功分别开创峨眉派和武当派。