沈万三是正常死亡。

沈万三在云南边陲度过了一生中最后的岁月，沈万三于1392年追随张三丰到福泉山修道，后逝于平越，1393年，沈万三仙逝后安葬于福泉山（贵州省福泉市福泉山下，现如今福泉山下仍有沈万三墓）。

明弘治11年(1498年)由其五世孙沈延礼（又名沈安）率子沈博及女沈琼莲将沈万三遗骨从福泉山迁葬江苏周庄银子浜，名水底墓。民间传说，银子浜的尽头有水一泓，下通泉源，旱岁不枯。水下有一个古墓，非常坚固，里面埋葬着沈万三的灵柩。