窦氏是京兆平陵人(今陕西武功)，北周定州总管神武公窦毅与北周襄阳长公主之女，聪慧刚毅，颇有才华。据说这位太穆皇后生来不凡，刚出娘胎头发就长过颈项，三岁时这头发就已经与她的身高一样长短了。周武帝对这位外甥女非常喜爱，自幼就将她养在宫中。窦氏年幼时被舅父周武帝宇文邕抚养于宫中，很受宠爱。她曾因劝谏周武帝亲近和亲的突厥公主而得到周武帝称赞，当时窦氏可能只有六七岁年纪，能有如此见解，顿时语惊四座。周武帝第一个正色以对，立即接纳小甥女的进谏，从此对阿史那皇后态度大为转变。认为她小小年纪，见识不凡。