1、首先要根据遗传材料选择合适的作图群体。

2、再应用分子标记技术对基因型进行标记分析，确定标记间的连锁关系。

3、利用合适的分子标记进行分析。

4、利用计算机软件进行图谱构建，建立标记间的连锁排序和遗传距离。

5、利用计算机软件绘出遗传图谱这几个部分，构建连锁图谱。