DNA分子是由4种核苷酸排列组成，DNA序列就是组成某一DNA分子的核苷酸的排列次序。蛋白质的一级结构是由20种氨基酸线性排列构成。蛋白序列就是构成某种蛋白质如氨基酸线性排列次序。

基因组中的DNA序列可以分为两大类：一类是单一序列，即在基因组中这种核苷酸的排列次序只出现一次或只有一份拷贝另一类是重复序列。指某种核苷酸排列次序在基因组出现的次数或其拷贝数少则几份，十几份，多的可达几万份甚至几十万份。

构成基因的极大多数是单一序列。重复序列则基本上全是非编码序列，它们的生物学功能是一个尚未解开的谜团。